医院具有鲜明的医疗特色，创建和发展了一批重点特色品牌学科，拥有全军骨髓移植中心、全军肿瘤中心、全军中毒救治中心、全军放射病研究调节中心、全军采供血中心等五个全军医学专科中心，其中全军骨髓移植中心为亚洲大的造血移植中心，开展骨髓、外周血造血移植调节血液病、实体瘤和自身免疫性疾病，累计完成各类造血移植2100余例，早期死亡率由已往的10%降至3.5%，居全国领先水平，国内领先水平，并跻身于国际先进行列;全军中毒救治中心多次参与国内重大化学毒物中毒事故应急救援，以急救医学、呼吸、消化和肾内科为基础学科，结合ICU、血液净化、高压氧、毒物检测等特殊诊治手段，成功救治各类中毒病人数千例，国内先进水平。
