内蒙古医科大学附属医院目前拥有PET/CT、64排CT、3.0T核磁共振、C型臂数字减影血管造影机、ECT机、全数字化彩色多普勒超声诊断系统、全自动生化分析仪等先进设备，在质量和数量上均属区内领先。医院设有外临床医学研究中心、外科实验室、临床应用实验室、新药临床机构办公室等国内的临床医学研究中心，为医院研究人员进行医学科学研究提供良好的平台。
医院近年制定出台《内蒙古医科大学附属医院特聘教授实施细则(试行)》、《内蒙古医科大学附属医院客座教授聘任办法(试行)》等，聘请有特长的知名专家作为特聘教授，来院进行业务和科研指导。
医院不断加强国内、国际间交流，定期派出专业人员到国内外学习深造，邀请国内外知名专家来院讲学，先后与美国、日本、蒙古、台湾、香港等和地区建立了技术合作交流与人才培养协议。