医院开展了心脏、全脑及外周血管造影检查、支架植入术，食道及肠道支架置入术，肿瘤血管内化疗、血管内栓塞术、射频消融术、*起搏器置入术，关节镜、腹腔镜、宫腔镜、支气管镜和消化内镜的镜下微创调节术，玻璃体切割术、白内障超声乳化术、斜视矫正术、全髋和全膝关节置换术，超声、CT和DSA引导下的介入调节术，机器人下立体定向定位功能神经外科手术及微创颅内血肿清除术、脑瘤切除术等多项新技术，其中年心脏、全脑、外周血管等介入检查调节近3000人次，胃、肠镜检查调节年近10000余人次。
北京京煤集团总医院注重科技创新，积极引导科研成果向临床应用转化。年均在核心期刊发表学术论文近百篇，各层级科研立项逐年递增，与国内多家知名医疗机构合作承担多项科研项目。