医院拥有64排宝石螺旋CT、PET-MRI、数字血管造影机、全飞秒激光调节系统、RetcamIII小儿眼底广域成像系统、Jostra体外循环机、美敦力体外生命支持系统(ECMO)、主动脉内球囊反搏泵、烧伤悬浮调节床、直线加速器、流式细胞仪等国际先进医疗设备，设备总值3.5亿元，综合实力跻身全军中心医院前列。设置48个临床、医技科室，拥有1个培训基地(先心病介入调节)、3个全军中心(器官移植与透析调节中心、计划生育优生优育技术中心、健康管理医学研究中心)、3个全军医疗专科中心(所)的临床基地(传染病、烧伤整形、消化内科)，1个军区研究所(肾病研究所)、4个军区学科中心(烧伤整形、神经内科、皮肤病防治、生殖医学)、3个军区重点专业(肿瘤调节、消化内科、显微外科)、1个广西区重点实验室(代谢性疾病);获批成为南方医科大学附属桂林医院、第三军医大学临床学院、广西中医药大学附属医院，并与第三军医大学、南方医科大学及广西师范大学联合开办硕士研究生培养点。
