广西壮族自治区妇幼保健医院加强学科专科建设，妇科、产科先后成为广西临床重点专科;妇科、产科、医学遗传学科、超声影像科6个学科成为广西妇幼健康服务重点学科。医院儿科建设特色鲜明，拥有儿科系列的新生儿科、儿童重症医学、儿童内分泌科、儿童消化内科儿童群体保健科、儿童耳鼻喉保健科，产科系列的母体医学、胎儿医学、MICU、孕期营养科、孕期心理科，拥有妇科系列的生殖健康科、生殖中心、妇科内分泌科、更年期保健专科等。
医院重视科研发展，近年获省级及以上科研项目41项。其中广西科学技术进步奖二等奖4项，广西医药卫生适宜技术推广奖一等奖3项。全国妇幼健康科学技术奖二等奖2项。发表各类学术核心论文近两千篇，国内核心期刊:853篇，而且普通期刊759篇。