新疆军区总医院前身为国民党联勤总部第60医院，新疆和平解放后，1950年1月整编建院。历经10多次编制调整，1986年定编为兰州军区乌鲁木齐总医院。2016年隶属陆军建制，改称新疆军区总医院。医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性三级甲等医院，是新疆维吾尔自治区、新疆生产建设兵团以及乌鲁木齐市医疗保障制度改革定点医疗单位。
新疆军区总医院前身为国民党联勤总部第60医院，新疆和平解放后，1950年1月整编建院。历经10多次编制调整，1986年定编为兰州军区乌鲁木齐总医院。2016年隶属陆军建制，改称新疆军区总医院。医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性三级甲等医院，是新疆维吾尔自治区、新疆生产建设兵团以及乌鲁木齐市医疗保障制度改革定点医疗单位。