医院重点学科建设卓有成，拥有中医药管理局“十二五”重点专科肾病科;上海市医学重点专科康复科、烧伤科;上海市中医临床优势专科肾病科、骨伤康复科;上海市中医临床重点学科中医肿瘤病学;上海市中西医结合重点病种湿疹;上海市中医临床重点扶持项目水火烫伤;上海市中医医疗机构综合调节区;上海市中医薄弱领域专科儿科;上海市中西医结合儿科专项;上海市妇幼健康中医专项建设中医妇科能力提升项目;浦东新区重点学科群糖尿病足中西医结合综合管理;浦东新区重点学科神经内科、影像医学与核医学科、中西医结合男性病学、危重病急救医学、泌尿外科;浦东新区重要薄弱学科病理及检验学、康复医学、中医外科学、麻醉学;浦东新区重点专科传统医学老年病科、甲状腺外科;浦东新区重点专病陆氏针灸疗法调节糖尿病周围神经病变、中西医结合防治产后盆底功能障碍性疾病、慢性阻塞性肺病及哮喘专病、下肢动脉硬化闭塞病、中西医结合MDT调节甲状腺疾病。