医院前身为创建于1907年的南通州基督医院，为南通第一所西医院。1951年医院由人民政府接办，1994年医院被评审为三级综合性医院，2008年晋级为三级甲等综合性医院。医院占地4.5万平方米，建筑面积12万平方米。现有职工2050人，医护员工1688人，高级职称378人，教授4人，副教授24人，博士生导师1人，硕士生导师65人。开放床位1641张，开设43个病区，33个临床专科，21个医技科室，49个专科门诊、69个专病门诊。南通市临床检验中心亦设在该院。拥有Force 双源CT、3.0T及1.5T核磁共振、大平板DSA、SPECT-CT、瓦里安直线加速器、十二指肠镜、小肠镜、超声胃镜等先进医疗设备。截止2019年底，全院总诊疗人次119.22万人次，出院患者7.25万人次。