始建于1976年，前身为温州医学院白求恩门诊部，1982年成立温州医学院附属第二医院。1988年兼挂温州医学院附属儿童医院牌子。1991年在台胞何朝育先生捐助下，新建儿童医院大楼，同时将儿童医院更名为温州医学院附属育英儿童医院。2004年增挂浙江省立育英医院。2005年兼并温州心血管病医院，设立附属第二医院南浦院区。2009年4月设立“附二医骨科医院”和“附二医妇产医院”两个院中院。目前医院设学院路院区、南浦院区、龙湾院区、瓯江口院区、台州妇女儿童院区、龙湾康复院区六大院区。其中，龙湾院区、瓯江口院区、台州妇女儿童院区、龙湾康复院区正在兴建中，预计将在未来两年相继开业。