医院于2002年经省药监局批准建立制剂室并通过GMP认证，开发具有自主知识产权的强骨、活骨、密骨、祛风胶囊。医院已进入集团化管理模式，下辖浙江现代手足显微研究院、台州市手•显微外科研究所、台州市骨伤科研究所、台州市股骨头坏死研究所、台州博爱肿瘤研究所和厦门翔安平安医院、龙游肿瘤医院、温岭联合医院、三门分院、临海分院。骨科学经浙江省卫生厅2014年验收为第二轮浙江省县级龙头学科;显微外科学于2014年10月被卫生厅评为特色学科。其中骨科学细分为脊柱科、关节科、手足显微外科、创伤骨科、小儿骨科、中医骨科、针炙推拿科及康复理疗科。2013年经市委人才领导小组批准设立“台州市孙捷名医工作室”，2014年经区委批准设立“路桥区汤志刚名医工作室”，工作室广泛吸纳台州市内的骨科专家及年轻英才加盟，同年经中医药管理局批准为“全国中医学术流派传承工作建设单位”及“南少林骨伤流派传承工作室台州市博爱医院工作站”。肿瘤学科及手足显微外科被省卫生厅评为省第三批基层卫生适宜技术示范基地。肿瘤学科被台州市抗癌学会列为重点扶持学科，肿瘤生物免疫调节和肿瘤深部热疗，高强度聚焦超声调节等技术国内领先水平。此外，在本地区民营医院率先开展腹腔镜、胸腔镜、宫腔镜等微创技术。在台州地区有一定的品牌和影响力。
