1997 年以来，妇幼保健院对全区 4 所产科医院，进行了助产技术的管理与业务培训，指导他们业务通过了北京市卫生局助产单位评估验收，进一步规范了全区的产科工作，保障了母婴的生命。 1999 年，制定了门头沟区孕产妇保健系统管理办法及儿童保健系统管理办法，通过在全区 26 家医疗机构的实施，大大提高了门头沟区的孕产妇、儿童系统管理率，有地降低了孕产妇、围产儿死亡率。
门头沟区妇幼保健院 , 建筑面积 2513 平方米，全院设置床位 30 张。设有行政科室、保健部、护理部、医务科、门诊部、信息科、总务科、器械科、病案室、图书室共 13 个职能科室。设有临床一级科室 4 个即：妇科、产科、儿科、预防保健科。设有保健一级科室 5 个即：妇女保健科、儿童保健科、生殖保健科、健康教育科、信息资料科。设有医技科室 6 个即：药剂科、放射科、检验科、功能检查科、营养科、消毒供应科。拥有全自动生化分析仪、多功能麻醉机、美国 GE B 超机、血细胞分析仪、尿分析仪、输液泵等万元以上的医疗设备 22 台。