合肥工业大学隶属教育部，是“211”工程重点建设院校，1960年被列入全国重点大学。学校医院始建于1954年，经过50多年的建设与发展，已成为一所科室齐全、管理严格、服务优质，有较强实力和社会知名度的高校职工医院。担负着全校医疗保健、公共卫生监督、健康教育、计划免疫、公费医疗管理、社区卫生服务等多项职能，是服务于全校近7万师生员工的医疗保健和卫生宣教中心。
1995年合肥工业大学医院通过安徽省卫生厅组织的等级医院评审，被评定为安徽省高校系统一级甲等医院。2000年被省劳动和保障厅审定为首批医疗保险定点医疗机构，是安徽省物价局、质量技术监督局审定通过的物价、计量合格单位，同时也是合肥市计划免疫预防接种定点单位。医院多次被省教育厅、卫生厅授予“安徽省学校卫生先进单位”光荣称号，医院院长被教育部授予“全国学校卫生工作先进个人”光荣称号。