医院始终坚持“科教兴院”的宗旨，高度重视科研教学工作。医院为南京中医药大学江阴附属医院，也是安徽中医药大学、江西中医药大学科技学院、加拿大温哥华国际中医学院、日本大阪森之宫医疗大学的教学医院，上海中医药大学教学基地，每年接收国内、外进修实习生200多名。注重医学研究引导，以临床疗为宗旨，探索切实解决常见病、多发病的新方法、新思路，每年引进新技术、新方法、新项目20多个。充分依托大学和医学科研机构，以中医药为重点，在特色上下功夫，为医院的发展注入新的活力。中医药科研工作处于领先地位，近三年有4个课题分别获得省、市科技成果奖，出版了学术专著4部，每年在国内外发表学术论文100多篇。目前20多个省、市级科研项目正在进行过程中，并参与了“973”重点基础研究项目。开发研制的“尿素乳膏”、“保儿宁口服液”、“痤疮颗粒”、“克银合剂”等近60种专科制剂疗显著，久负盛名。
