医院设有内分泌科、肾内科、神经内科、呼吸内科、肿瘤内科、心血管内科、消化内科、风湿免疫科、血液科、泌尿外科、肿瘤外科、胸外科、肛肠外科、骨外科、心血管外科、麻醉科、皮肤科、乳腺外科、重症医学科、手术室普外科、神经外科、生殖医学科、妇科、产房新生儿科、产科、普儿科、口腔修复科、口腔颌面外科、心理咨询注射室、急诊科、疼痛门诊、高压氧科、CT室、核磁室、放射科理疗科、血透室、心电图、病理科、康复中心、检验科、供应室、核医学科、输血科、超声科、中医科、耳鼻喉科、眼科、验光配镜中心等临床和医技科室。其中泌尿外科是临床重点建设专科，泌尿外科、口腔修复正畸科、心血管内科是内蒙古自治区临床医学重点学科，胸外科、神经内科和肿瘤内科是自治区重点学科