医院创建于1960年，原名“浙江省建工医院”。是一所集医疗、教学、科研和健康管理为一体的大型综合性三级甲等医院、全国三级甲等中西医结合医院、第三批全国重点中西医结合医院，也是浙江中医药大学直属的附属医院。2003年成建制划转至浙江中医药大学，更名“浙江省新华医院”。2006年更名为“浙江中医药大学附属第二医院、第二临床医学院”。医院总建筑面积6万余平方米，设施齐全，医师团队技术力量雄厚，而且拥有多套先进的医疗设备，为广大人士提供优质的医疗服务。
医院先后被评选为全国卫生系统先进集体、浙江省中医“名院”、浙江省健康促进医院。医院牵头组建(浙江省)中医应急救治医疗队，并入选全国首批中医药传承创新工程重点中医医院建设备选项目，获批中医临床研究基地建设单位。
医院将一如既往地践行“大医精诚，患者至上”的核心价值观，遵循“走质量型增长、内涵式发展道路”的发展理念，积极适应公立医院综合改革新常态，不忘初心，牢记使命，为把医院建设成为一所“布局合理、功能完善、环境舒适、服务规范、医疗、诚信和谐、中西医结合特色优势鲜明，在全国重点中西医结合医院中有一定知名度的”高水平大学附属医院不懈奋斗!