重庆三峡医药高等专科学校第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复为一体的二级甲等综合医院，是重庆市全科医学专科规范化培训基地和社区健康管理实验基地，医院设有神经内科、肾内科、泌尿外科、普外科、神经外科、肝胆外科、儿科、妇产科、骨科、肿瘤科、心血管科、消化科、呼吸科、糖尿病科、五官科、康复科、皮肤科、检验科、放射科、电生理科、超声科等临床和医技科室，其中皮肤科、针灸康复科、中西医结合肿瘤科为重庆市级特色专科;皮肤科、针灸康复科为万州区医学重点学科。医院编制床位400张，开设床位350张，拥有全身螺旋CT、数字X线成像系统(DR)、十二导动态心电分析系统、动态血压仪、全自动生化仪CS-800B、电化学发光全自动免疫分析系统、彩色超声多普勒系统、电子胃镜、电子肠镜、腹腔镜、电切镜、经皮肾穿调节肾输尿管结石系统、热疗机、粒子刀、大型超脉冲激光调节机、多参数监护仪、呼吸机等医疗设备。