遵义医学院口腔系1978年成立，1998年成立口腔医院为独立法人单位，2007年口腔系更名口腔学院，2017年口腔学院更名为口腔医学院，2019年更名为遵义医科大学口腔医学院。口腔医院和口腔医学院实行 "两院合一"管理体制，接受贵州省卫生厅和遵义医学院双重领导，该院已成为贵州省集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等口腔专科医院现有在职职工300余人，其中博士15人、(其中二级教授2人，三级教授1人)硕士88人、本科141人，每年接收规范化培训医生近60名，培养研究生30余名。
遵义医科大学附属口腔医院设门诊部、住院部等业务点，开展口腔医疗及预防服务，现有20余个临床医疗业务科室，开放牙科椅位80张，开放床位数81张，该院是贵州省中国"微笑列车"行动A级合作医院、贵州省口腔医疗质量控制中心、贵州省口腔类执业医师资格技能考试基地、贵州省口腔专科医师培训基地、贵州省口腔医学美容培训基地、贵州省口腔医学人才基地、贵州省教学团队、贵州省临床重点专科、中华口腔医学会口腔专业护士临床实践培训基地、遵义市医保定点医院。
口腔医学院的科研水平在省内首屈一指，在龋病防治、牙周病防治、头颈部肿瘤防治和口腔组织工程等方面处于全国先进水平。近年来先后承担了“十三五”重点专项、“973”重大课题子项目、自然科学基金项目等、省(部)级和厅级科研课题攻坚150余项，先后获得省(部)、厅级科技成果奖20项。与四川大学、北京大学、第四军医大学、上海交通大学、武汉大学等国内知名高等院校和美国哈佛大学牙学院、美国马里兰大学牙学院、澳大利亚阿德莱德大学牙学院、香港大学牙学院、德国杜赛尔多夫大学和瑞典乌默奥大学牙学院等国外大学有着广泛的科研合作和学术交流。