医院设4部(医教部、政治部、院务部、护理部)，40个临床和医技科室：心血管内科、呼吸内科、消化内科、血液内分泌科、肾内科、普外科、肝胆外科、血液内分泌科、肾内科、普外科、肝胆外科、脑外科、胸外科、骨科、泌尿外科、烧伤科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、整形美容外科、神经内科、皮肤科、中医科、传染病科、肿瘤科、康复理疗科、病理科、放射科、核医学科、超声诊断科等。其中重点学科1个(烧伤研究所)，全军专科技术中心5个(烧伤、肝胆、传染、妇产、药理);博士学位授予权学科9个(烧伤、肝胆、传染、消化、泌尿、骨科、心内、皮肤、康复)，硕士学位授予权学科28个。
此外，先后建有星源激光调节中心，心肌激光调节中心，帕金森氏病调节中心，肾病透析中心，介入调节中心，整形美容中心，基因诊断调节中心，眼底病调节中心，屈光不正准分子激光调节等专病中心。诊疗设备有核磁共振(MR)、CT、ECT、X线刀、直线加速器、数字减影仪、彩色B超、自动生化分析器，各种内窥镜、细胞刀、聚能刀、多弹头自动导航调节系统等。