截至2014年12月，硕士生导师158名，博士生导师88名，设有3个博士后流动站，19个博士点、28个硕士点。医院现有1个组织工程工程研究中心，1个教育部数字医学工程研究中心，上海市组织工程重点实验室、上海市口腔医学重点实验室和上海市骨科内植物重点实验室。拥有上海市整复外科研究所、上海市口腔医学研究所、上海市生物材料研究测试中心和上海交通大学医学院眼科视觉研究所。上海市科技功臣1人，上海市十大科技精英2人。有中国工程院院士3人，973科学家1人，杰出青年3人，长江特聘/讲座教授4人，新世纪百千万工程人选3人、教育部跨世纪人才计划4人、人社部突出贡献中青年专家1人、卫生部突出贡献中青年专家4人、上海市领军人才10人，以及上海市科委学科带头人、启明星(后)、曙光计划、医学领军人才等市级以上人才培养计划100多人次。九院现为上海市住院医师规范化培训基地和专科医师培训基地。
