近几年来，医院共获得自然科学奖二等奖1项，科技进步二等奖1项，教育部高等学校科学研究成果奖一等奖2项，省部级科研奖励33项。承担项目407项，其中承担“十三五”重点研发专项2项、“973”项目4项，科技部科技援外项目1项，自然基金重点项目2项，青年科学基金项目2项。2015年至2020年，医院自然基金立项数连续六年排名吉林大学第一位。近五年，医院发表中科院分区小区二区以上文章1220篇，位居2019年中国科学技术信息研究所公布的“中国科技论文统计结果”全国第7名(东三省第一)。医院现有省部级及以上平台17个，包括发改委批复的“人类疾病动物模型地方联合工程实验室”，药监局“疫苗与细胞调节产品人源化动物模型评价”重点实验室，教育部“器官再造与移植”重点实验室。
