2014年成立兰州大学第二医院住院医师规范化培训基地，是首批住院医师规范化培训基地之一，共拥有内科、、儿科、急诊科、皮肤科、精神科、神经内科、全科、重症医学科、外科、外科(神经外科方向)、外科(胸心外科方向)、外科(泌尿外科方向)、外科(整形外科方向)、骨科、儿外科、妇产科、眼科、耳鼻咽喉科、麻醉科、临床病理科、检验医学科、放射科、超声医学科、核医学科、口腔全科、口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复科等28个专业;2020年儿科专业基地获得全国重点专业基地。培训师资力量雄厚，培训设施、设备齐全，萃英临床技能教学中心占地3500余平方米，培训模拟设备种类齐全。自2015年2月开始,共计招生1922人，目前累计考核合格并取得颁发的《住院医师规范化培训合格证》共895人。
