北医三院有3个教育部创新团队：骨科、运动医学研究所、妇产科;1个临床研究中心：妇产疾病;1个教育部重点实验室：辅助生殖;1个卫生健康委重点实验室：心血管分子生物学与调节肽;8个北京市重点实验室：磁共振成像设备与技术、脊柱疾病研究、生殖内分泌与辅助生殖技术、心血管受体研究、运动医学关节伤病、幽门螺杆菌感染与上胃肠疾病、眼部神经损伤重建保护与康复、神经退行性疾病生物标志物研究及转化;3个北京市国际科技合作基地：出生缺陷防控、冠心病临床与基础研究、仿生钛骨科内植入物。
北医三院有3个教育部创新团队：骨科、运动医学研究所、妇产科;1个临床研究中心：妇产疾病;1个教育部重点实验室：辅助生殖;1个卫生健康委重点实验室：心血管分子生物学与调节肽;8个北京市重点实验室：磁共振成像设备与技术、脊柱疾病研究、生殖内分泌与辅助生殖技术、心血管受体研究、运动医学关节伤病、幽门螺杆菌感染与上胃肠疾病、眼部神经损伤重建保护与康复、神经退行性疾病生物标志物研究及转化;3个北京市国际科技合作基地：出生缺陷防控、冠心病临床与基础研究、仿生钛骨科内植入物。