医院现有2个院区，现有职工9600余人。2009年医院组建医联体，现已拥有106个成员单位，打造出了一张以吉林大学第一医院为核心、纵跨省内外的医疗协作网络。医院学科齐全，专科特色。现有1个重点学科，17个临床重点专科建设项目，68个临床科室，5个门诊科室，12个医技、辅助科室，92间手术室，1个转化医学研究院，并设有基因检测中心、体检中心、国际健康促进中心、I期药物临床试验病房、日间病房等。同时，拥有1个师资培训中心，1个地方联合工程实验室，1个教育部重点实验室，9个吉林省科技厅重点实验室，9个科技厅吉林省研究中心，14个吉林省发改委工程实验室及研究中心，13个吉林省卫生厅重点实验室， 9个吉林省重点学科。2011年，医院被批准为临床医学一级学科博士学位授权点。医院主办的《中风与神经疾病杂志》和《临床肝胆病杂志》为核心期刊。
