长春市儿童医院口腔科成立于1989年，是集医疗、教学和科研为一体的临床科室，也是目前吉林省的专门调节儿童和青少年口腔疾病的科室。现在有医护人员8名，其中教授1名，副教授4名，副主任护师1名，主管护师2名。该科现有吉林省和长春市口腔集团董事1人，吉林省和长春市医学会医疗事故鉴定专家组成员1名，每年招收一定数量的硕士研究生和进修生。科室主要诊治18岁以下儿童及青少年龋病、非龋性疾病、牙髓疾病、根尖周疾病、牙外伤、牙周黏膜疾病和开展儿童及青少年咬合诱导，牙列不齐，缺隙管理，早期矫治、鹅口疮、地图舌、疱疹性口炎、慢性唇炎、舌炎、唇/舌系带延长术、粘液腺囊肿切除术、外伤清创缝合术、多生齿、埋伏牙拔除、口腔预防保健等。
