上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身“伯特利医院”创建于1920年。1952年更名为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院(以下简称“九院”)，2005年上海第二医科大学与上海交通大学正式合并，九院改名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。建设水平不断发展。医院现拥有3个上海市临床医学中心(口腔临床、整复外科、关节外科)和2个上海市临床医疗质量控制中心(口腔医学、医学美容)。口腔临床医学、整复外科与组织工程学、外科学(骨科)现为重点学科，心血管内科为重点学科组员单位(牵头单位瑞金医院);口腔基础医学现为重点培育学科。骨科、口腔颌面外科、牙体牙髓科、牙周科、口腔修复科、眼科、整复外科、口腔正畸科、口腔黏膜科、耳鼻咽喉-头颈外科为临床重点专科。口腔医学、整复外科学、骨科学为教育部“十二五”“211工程”重点建设学科。口腔黏膜病科列为中医药管理局重点专科。九院目前还是英国爱丁堡皇家外科学院头颈与肿瘤培训中心单位、口腔颌面外科医师协会(IAOMS)口腔肿瘤外科与修复重建培训中心单位和口腔颌面外科内固定学会(AOCMF)颅颌面分会培训中心单位。
