吉林大学中日联谊医院有四个院区，中心院区位于位于吉林省长春市仙台大街126号，新民院区位于新民大街829号，南湖院区位于南湖新村东街1028号，开运院区位于开运街1433号，始建于1949年11月，总占地面积32.38万平方米，建筑面积32万平方米，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性三级甲等医院，是吉林省和长春市医保、新农合定点医院，是卫计委冠心病介入诊疗培训基地、心律失常介入诊疗培训基地、外周血管介入诊疗培训基地、消化内镜培训中心、皮肤医疗美容示范基地，是卫计委国际紧急救援中心网络医院、药物临床试验研究机构、吉林省紧急救援培训鉴定中心、吉林省紧急救援定点医院，先后荣获爱婴医院、全国青年文明号、吉林省文明服务单位、吉林省青年文明号、长春市职业道德建设示范单位等荣誉称号。
