医院科室设置齐全，人才济济，设备先进，专科特色显著。共有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个，核定床位800张。医院现有职工1073人，具有高级职称者181人，硕博士143人。已故的朱良春先生为国医大师。有全国名老中医药专家学术经验继承工作指导老师2人、享受国务院专家特贴4人、江苏省名中医3人、南通市名中医12人。全国及省名老中医药专家带徒13人，全国中医研修人才7名，省中医药领军人才1名，省“333”工程第三层次培养对象1名。该院目前拥有名医工作室4个，分别是国医大师朱良春学术经验传承研究室、邵荣世全国名老中医药专家传承工作室、周光省名老中医药专家传承工作室和倪毓生省名老中医药专家传承工作室。目前，外科为中医药管理局重点专科;外科为卫计委中医临床重点专科建设单位、脾胃病科为中医药管理局重点专科建设单位;中医外科学和中医脾胃病学为江苏省中医药重点学科。脾胃病科、骨伤科、妇科，肺病科、肾病科为省重点专科。另有11个市级重点专科。
