医院在国内较早装备PET-MR、第六代头部伽玛刀、第二代达芬奇手术机器人系统、360脑磁图、术中放射调节系统和小动物PET-CT等设备，还拥有PET-CT、、磁共振(MRI3.0T)、256层CT、第二代64层双源CT、SPECT、SPECT/CT、磁导航DSA、、三维调强直线加速器等一大批高精尖仪器，医疗设备国际先进水平。瑞金医院还承担了中国首套自主研发质子调节设备的临床研发工作，建成后将成为国内首屈一指的具有完全自主知识产权的现代化质子调节中心。
医院在国内较早装备PET-MR、第六代头部伽玛刀、第二代达芬奇手术机器人系统、360脑磁图、术中放射调节系统和小动物PET-CT等设备，还拥有PET-CT、、磁共振(MRI3.0T)、256层CT、第二代64层双源CT、SPECT、SPECT/CT、磁导航DSA、、三维调强直线加速器等一大批高精尖仪器，医疗设备国际先进水平。瑞金医院还承担了中国首套自主研发质子调节设备的临床研发工作，建成后将成为国内首屈一指的具有完全自主知识产权的现代化质子调节中心。